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二代测序仪的主要技术指标包括：读长（单端75–300 bp，双端150 bp×2）；单次运行通量（10–1500 Gb）；测序质量Q30（≥85%）；准确率≥99.9%；运行时间（2–48小时）；样品通量（1–48个样本/批，支持多种index）。配备高灵敏度光学检测系统及自动化数据分析流程，可针对不同应用选择相应芯片与试剂。
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二代测序仪的主要功能：对DNA或RNA样品进行高通量并行测序，快速获得核酸序列信息。支持全基因组测序、靶向测序、转录组测序、表观遗传学分析及宏基因组测序等。可检测单核苷酸变异、插入缺失、拷贝数变异及基因融合，广泛应用于疾病诊断、药物研发、遗传育种及微生物鉴定等领域。
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二代测序仪的服务内容包括：提供从核酸提取、文库构建到上机测序的全流程服务；支持全基因组、转录组、靶向测序及宏基因组等应用；提供原始数据质控、比对、变异检测等生物信息分析；出具测序报告；并可开展仪器操作培训、实验方案设计及数据分析指导等技术支持。
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二代测序仪用户须知：样本需保证DNA/RNA完整、无降解，浓度及纯度符合建库要求。操作前进行试剂解冻与仪器自检，防止污染。运行中勿中断测序过程，避免强光直射光学系统。测序后及时备份数据并清理废液。定期校准温控模块与光学检测系统，操作人员需经专业培训。
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